Marina Ibiza colabora también con la Fundación Palma Aquarium en su programa de rescate de tortugas marinas, otra de las especies más vulnerables y en serio peligro de extinción.

Para ello se encuentra disponible en la marina un depósito especial para los animales que necesiten asistencia, y así, cuando los clientes de Marina Ibiza salen a navegar y encuentran una tortuga o cualquier otro animal marino en apuros, pueden llevarlos hasta la marina, dónde son recogidos y trasladados a la Fundación Palma Aquarium para ser atendidos y tratados por veterinarios y biólogos para ser liberados después de su recuperación.